а также зеркало открывает также как и скачать с сервера . А не новое окно

Находим в каталоге файлов\ Страница материала и комментариев к нему\ там находите :

<a href="$FILE_URL$">Скачать с сервера</a> ($FILE_SIZE$)
· <a href="$RFILE_URL$" target="_blank">Скачать удаленно</a> ($RFILE_SIZE$)

Меняете на :

<input type="button" onclick="window.location='$FILE_URL$'"<input type="button" VALUE="Скачать с сервера($FILE_SIZE$)" onClick="openLayerB(');">
<input type="button" onclick="window.location='$RFILE_URL$'"<input type="button" VALUE="Скачать с зеркала($RFILE_SIZE$)" onClick="openLayerB(');">